一、案件受理
二、初步核實：案件線索需經(jīng)高校紀(jì)委或上級主管部門紀(jì)工委領(lǐng)導(dǎo)批準(zhǔn)初核，初核方法可采取直接派人調(diào)查；責(zé)成或委托有關(guān)黨組織進(jìn)行；對線索不具體或?qū)儆谝话悴徽L(fēng)的問題也可要求被反映人直接做出說明。初核一般應(yīng)向被調(diào)查者所在黨組織或上級黨組織適時通報情況，時限為2個月，必要時可延長1個月，重大或復(fù)雜的問題經(jīng)批準(zhǔn)后可再適當(dāng)延長。初核后，應(yīng)寫出初核情況報告，確有違紀(jì)事實需要追究黨紀(jì)責(zé)任的，應(yīng)呈報立案。已構(gòu)成犯罪的，應(yīng)及時移送司法機關(guān)。經(jīng)紀(jì)律審查屬于違紀(jì)事實輕微不需要追究黨紀(jì)責(zé)任的應(yīng)建議有關(guān)黨組織做出恰當(dāng)處理。
三、立案：按照干部管理權(quán)限和線索來源，由被調(diào)查人所在高校紀(jì)委立案或由上級紀(jì)委或紀(jì)檢組織直接立案。紀(jì)委在決定立案前，應(yīng)征求同級黨委意見。紀(jì)檢機關(guān)寫《立案決定書》并通報同級黨委組織部門或干部管理部門。
四、案件調(diào)查：包括調(diào)查和取證，時限為3個月，必要時可延長1個月，是案件檢查工作的主要階段和中心環(huán)節(jié)。調(diào)查結(jié)束需形成調(diào)查報告。行政監(jiān)察機關(guān)、公安機關(guān)民檢察院、人民法院移送的需給予黨紀(jì)處分的案件。其中，需要進(jìn)一步調(diào)查取證的，由受理案件的紀(jì)委檢查部門或商請移送案件的機關(guān)補充調(diào)查后移送審理。需要個別調(diào)查補充證據(jù)的，由受理案件的紀(jì)委審理部門調(diào)查補證。）
五、案件審理：對調(diào)查終結(jié)需追究黨紀(jì)責(zé)任的違紀(jì)案件，需要移交上級紀(jì)委或紀(jì)檢組織審核。審理結(jié)束需撰寫審理報告。其中，按照干部管理權(quán)限，對高校科級及以下黨員干部給予警告、嚴(yán)重警告、撤銷黨內(nèi)職務(wù)、留黨察看處分，由高校黨委或紀(jì)委批準(zhǔn)，給予開除黨籍處分，由高校黨委批準(zhǔn)。對高校副處級黨員干部給予警告、嚴(yán)重警告處分，由高校黨委批準(zhǔn)，給予撤銷黨內(nèi)職務(wù)、留黨察看、開除黨籍處分，由省教育紀(jì)工委批準(zhǔn)。對高校正處級黨員干部給予警告、嚴(yán)重警告、撤銷黨內(nèi)職務(wù)、留黨察看、開除黨籍處分，由省教育紀(jì)工委批準(zhǔn)。報審理部門需準(zhǔn)備以下材料：1、錯誤事實材料2、調(diào)查報告3、檢討書4、被調(diào)查人支部的處分決定5、移送函6、支部給黨委的請示7、黨委報審理部門的請示。
六、黨紀(jì)處分：黨紀(jì)處分的批準(zhǔn)權(quán)限是根據(jù)違紀(jì)黨員的隸屬關(guān)系、職務(wù)、所受處分的檔次等因素劃分的。必須經(jīng)過支部大會討論決定，報黨委批準(zhǔn)。黨員領(lǐng)導(dǎo)干部除按所在黨支部做出處分決定外，還要報管理這一級干部的黨委或同級紀(jì)委批準(zhǔn)。上級黨組織或紀(jì)檢機關(guān)審議形成決議后，應(yīng)起草批復(fù)，下達(dá)給下級黨組織或紀(jì)委執(zhí)行。犯錯黨員所在黨組織接到批復(fù)后應(yīng)在一個月內(nèi)向犯錯黨員本人宣布，并將處分決定或批復(fù)送交本人一份，并在基層黨委或黨支部范圍內(nèi)宣布，也可在一定范圍內(nèi)通報。在一個半月內(nèi)將處分執(zhí)行情況填寫《處分執(zhí)行情況報告表》上報批準(zhǔn)組織。
依據(jù)：依據(jù)《黨章》、《黨的紀(jì)律檢查機關(guān)案件審理工作條例》（中紀(jì)發(fā)〔1987〕12號）、《中國共產(chǎn)黨紀(jì)律檢查機關(guān)案件檢查工作條例》（中紀(jì)發(fā)〔1994〕4號）、《中共中央紀(jì)委關(guān)于進(jìn)一步加強和規(guī)范辦案工作的意見》（中紀(jì)發(fā)〔2008〕33號）、《關(guān)于進(jìn)一步加強和改進(jìn)新形勢下紀(jì)檢機關(guān)案件審理工作的意見》（中紀(jì)辦發(fā)〔2011〕25號）、《四川省紀(jì)檢監(jiān)察機關(guān)案件審理工作程序》（川紀(jì)發(fā)〔2006〕25號）等規(guī)定。
注：文中表述的上級紀(jì)委和紀(jì)檢組織包括市州紀(jì)委、教育廳紀(jì)工委、部門紀(jì)檢組。